Het magische koninkrijk Lucis is de thuishaven van de heilige Crystal, maar dat houdt het imperium Niflheim niet tegen om het zich toe te eigenen. De oorlog tussen de twee woedt al zo lang men zich kan herinneren.
Een baanbrekende roboticus ontwaakt in 2025 na tientallen jaren in cryoslaap. Om het verleden te veranderen en zich te herenigen met zijn geadopteerde zus, zoekt hij een weg terug naar 1995.
Wayne, een brandweerman in opleiding, staat in de woestijn te oefenen voor z'n examen als hij een meteoriet in ziet slaan. De volgende dag weten de leraren Ira Kane en Harry Block de meteoriet te pakken te krijgen. Ze nemen een monster, en zien dat er een blauwe vloeistof uitkomt. In de vloeistof zit een eencellig organisme, dat echter razendsnel evolueert tot een compleet wezen. Als de aliens zich beginnen te verspreiden gaat het leger zich er mee bemoeien.
Doctor Who en zijn metgezellen worden de toekomst in geslingerd en doen een gruwelijke ontdekking: de Daleks hebben de aarde veroverd! De metaalduivels hebben hele continenten verwoest en de overlevenden in Robomen veranderd.
Audry Lynch keert terug naar Block Island, waar ze tot de ontdekking komt dat haar vader black-outs en hallucinaties heeft. Na een intense nacht verdwijnt deze spoorloos, waarna Audry en haar broer Harry hun eigen onderzoek beginnen. De twee komen erachter dat hun familie in gevaar is.
De Jungle Beat-dieren vinden het het beste wat er ooit is gebeurd als een buitenaards wezen in de jungle arriveert en de kracht van spraak met zich meebrengt. Verrassend genoeg vinden ze het ook het beste wat ze ooit hebben meegemaakt als ze erachter komen dat hij gestuurd is om hen te verslaan.
De geniale kunstenaar Cesar Catilina probeert de stad Nieuw Rome naar een utopische, idealistische toekomst te loodsen, terwijl zijn oppositie, burgemeester Franklyn Cicero, zich blijft inzetten voor een regressieve status quo, waarbij hebzucht, speciale belangen en partijdige oorlogvoering worden bestendigd. Tussen hen in wordt de socialite Julia Cicero, de dochter van de burgemeester, verscheurd. Haar liefde voor Cesar heeft haar loyaliteit verdeeld en haar gedwongen te ontdekken wat zij werkelijk gelooft dat de mensheid verdient.
Deze film is verdeeld in twee delen: Het eerste deel, Death, vat afleveringen 1 tot en met 24 van de Evangelion-serie samen. Het tweede deel, Rebirth, beslaat de eerste 15 minuten van aflevering 25 (tv-aflevering 25 herwerkt, verbeterd en aangevuld met een eerder ongepubliceerd verhaal). Het Death-deel is een vrij willekeurige hermontage van de tv-serie. Deze hermontage bevat verschillende ongepubliceerde scènes, die in de videoversie van de tv-serie (die twee jaar na de eerste tv-uitzending werd uitgebracht) in de serie zijn geïntegreerd. Het Rebirth-deel is niet compleet, omdat Gainax geen tijd had om hun project (afleveringen 25 en 26) af te ronden. Er werd toen besloten om in maart een eerste film uit te zenden, waarin een voorproefje van het eindproduct (het Rebirth-deel) zou worden vertoond, en in de zomer een andere film, die dit keer de complete versie zou zijn.
Een gebouw bestuurd door artificial intelligence wordt gevoed door menselijke emoties. Door een softwarematige fout wordt de AI verliefd op een echt meisje. De AI weet het gebouw te ontvluchten en het lichaam van een echte man over te nemen. In deze hoedanigheid probeert hij de liefde van het meisje te winnen.
Vier slapeloze geneeskundestudenten worden meegelokt in een neuro-wetenschappelijk experiment dat uit de hand loopt en een uitweg moeten vinden voordat het te laat is.
Dr. Cordelier, woonachtig in een buitenwijk van Parijs, trekt zich terug uit de samenleving om onderzoek te doen naar de werking van het menselijk brein. Zijn levenslange vriend, Maître Joly, maakt zich zorgen wanneer Cordelier een testament opstelt dat zijn hele nalatenschap nalaat aan een vreemde, Monsieur Opale; hij kan niet begrijpen waarom Cordelier hem verdedigt, aangezien Opale vrouwen en kinderen aanvalt. Nadat een collega is vermoord, confronteert Joly Cordelier en ontdekt hij de waarheid achter het gedrag van zijn vriend.
Henry Brogen is een moordenaar op leeftijd, werkzaam voor de NSA, die van plan is zijn carrière de rug toe te keren. Zijn opdrachtgevers willen hem echter niet laten gaan en maken een kloon van hem. Hierdoor moet Henry het opnemen tegen zijn jongere en nog snellere en sterkere versie, een die al zijn handelingen kan voorspellen.
Tijdens de Eerste Wereldoorlog brengt een Duitse onderzeeër een Brits passagiersschip tot zinken en neemt de overlevenden aan boord. Nadat de onderzeeër in de mist is verdwaald, komt hij boven bij het onbekende eiland Caprona, een verloren wereld waar ze dinosaurussen en neanderthalers vinden.
In het jaar 2222 wordt een voormalige drugsdealer in een winterslaap gehouden. Gereanimeerd vertelt hij zijn verhaal. Als leider op de markt voor verdovende middelen was zijn situatie welvarend totdat de regering tijdens een politieke verandering het gebruik ervan legaliseerde.
Schoolvrienden C.J. en Sebastian zijn wetenschappelijke genieën en werken in hun vrije tijd aan hun nieuwste uitvinding: een rugtas waarmee je kunt tijdreizen. Maar als C.J.’s oudere broer Calvin na een aanvaring met de politie komt te overlijden, besluit het jonge duo hun onafgemaakte technologie op het spel te zetten in een poging om Calvin te redden.
