Manuel moest de haven van Munambam verlaten om aan de boot van St. Anthony . Onverwachte gebeurtenissen op de boot veranderen het leven van Manuel en de mensen die daar werken.
Vier jaar na de gebeurtenissen in de eerste Jurassic Park film verklapt John Hammond aan Ian Malcolm dat er nog een ander eiland was vol dino's. Deze zijn verder met rust gelaten, en Hammond is erg benieuwd naar de dieren in een natuurlijke omgeving.
Tijdens de Amerikaanse Burgeroorlog probeert een Zuidelijke gevangene, Clyde McKay, een doos met goud te stelen uit een gevangenkamp van de Unie. Hij wordt geholpen door een groep gevangenen en een gevangenisbewaker, maar onderweg wordt hij bedrogen.
Drie mensen worden getransporteerd naar een parallel universum. Daar ontdekken ze dat ze moderne technologie, maar ook middeleeuwse wapens, moeten gebruiken om de burgers te redden van een moordzuchtige krijgsheer.
